Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CACNA1SQ13698 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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