Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms