Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
GDAP2Q9NXN4 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GDAP2Q9NXN4 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms