Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SRRTQ9BXP5 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms