Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SYCP1Q15431 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms