Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
LAMB3Q13751 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAMB3Q13751 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms