Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ATP1A4Q13733 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms