Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMOD1P29536 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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LMOD1P29536 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
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LMOD1P29536 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
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LMOD1P29536 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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LMOD1P29536 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMOD1P29536 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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