Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CIPCQ9C0C6 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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