Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CCDC142Q17RM4 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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