Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CDKN3Q16667 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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