Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTCH1Q13635 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms