Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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SF3B2Q13435 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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SF3B2Q13435 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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SF3B2Q13435 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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SF3B2Q13435 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
SF3B2Q13435 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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