Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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MKRN4PQ13434 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 ENAH-209ENST00000635051 3308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 PBLD-202ENST00000309049 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
MKRN4PQ13434 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
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