Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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CLN3Q13286 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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CLN3Q13286 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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CLN3Q13286 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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CLN3Q13286 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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CLN3Q13286 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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CLN3Q13286 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CLN3Q13286 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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