Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SEMA3BQ13214 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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