Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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FOXC1Q12948 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 AKAP7-202ENST00000342266 2461 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
FOXC1Q12948 CLDN16-201ENST00000264734 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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FOXC1Q12948 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ZNF45-206ENST00000615985 2912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 CCDC15-201ENST00000344762 3893 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
FOXC1Q12948 ADAM3A-208ENST00000495171 2284 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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