Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SH3KBP1-203ENST00000379716 3819 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 IKZF2-202ENST00000374319 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 INPP5B-205ENST00000373027 3905 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SNRPB2-201ENST00000246071 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SLC8A1-209ENST00000408028 2898 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 HHAT-203ENST00000367010 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ATP6V1G1P2-201ENST00000522436 346 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 MIR5008-201ENST00000584300 94 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 PLRG1-201ENST00000302078 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SP110-215ENST00000540870 2032 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 PSG9-209ENST00000621109 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 CD274-202ENST00000381577 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 GEMIN6-201ENST00000281950 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 CFAP57-201ENST00000372492 4244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RTP3-201ENST00000296142 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RN7SKP239-201ENST00000364814 295 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 BSNDP4-201ENST00000436076 388 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 RPL23AP10-201ENST00000489946 466 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ALG1L12P-201ENST00000515046 434 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 MPPE1P1-201ENST00000557286 1076 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.120-201ENST00000614195 252 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AL356289.3-201ENST00000640049 2669 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 GABRB3-216ENST00000628124 5581 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ANAPC5-208ENST00000535482 2077 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 FLT1-203ENST00000540678 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 HKR1-202ENST00000392153 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CACNB1Q02641 LINC00837-201ENST00000443246 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms