Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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USP18Q9UMW8 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
USP18Q9UMW8 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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