Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms