Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 NBPF26-205ENST00000615219 2051 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 NBPF12-207ENST00000617864 2051 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 NBPF20-204ENST00000620821 2051 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 PRICKLE2-205ENST00000638394 9956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SLC28A2-201ENST00000347644 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AP000552.1-202ENST00000436681 3714 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 U3.33-201ENST00000408117 204 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AL356387.1-201ENST00000426321 476 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 LINC02024-203ENST00000496994 489 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 OR10Y1P-201ENST00000528485 974 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 CARMN-212ENST00000614896 536 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC245033.3-201ENST00000617986 224 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 MED15P6-202ENST00000621415 787 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 GOSR2-215ENST00000638374 2683 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 BFAR-201ENST00000261658 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SPIN4-201ENST00000374884 4117 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 ELAVL2-203ENST00000380117 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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CNKSR2Q8WXI2 ZNF366-201ENST00000318442 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 CCR9-203ENST00000395963 2512 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 NECAP1-210ENST00000638237 2517 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 KCNMA1-214ENST00000434208 4055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 TRIM51-202ENST00000449290 1629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 STAG3-202ENST00000394018 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AL136968.2-201ENST00000407959 354 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL370P-201ENST00000470869 295 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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CNKSR2Q8WXI2 MIR2052HG-204ENST00000523442 550 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC004241.1-203ENST00000552502 460 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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CNKSR2Q8WXI2 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AL136967.1-201ENST00000625120 441 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 GANC-206ENST00000566442 2512 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 ACVR2A-207ENST00000535787 5166 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 LRRC37A11P-201ENST00000425901 3580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
CNKSR2Q8WXI2 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CNKSR2Q8WXI2 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CNKSR2Q8WXI2 MCM8-204ENST00000378896 3769 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
CNKSR2Q8WXI2 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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