Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEDD1Q8NHV4 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEDD1Q8NHV4 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEDD1Q8NHV4 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEDD1Q8NHV4 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEDD1Q8NHV4 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEDD1Q8NHV4 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NEDD1Q8NHV4 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms