Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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LNX2Q8N448 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LNX2Q8N448 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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