Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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