Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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PKHD1P08F94 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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