Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LRIG3Q6UXM1 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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