Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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GRIK4Q16099 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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GRIK4Q16099 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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GRIK4Q16099 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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