Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CCDC85BQ15834 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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