Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms