Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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