Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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