Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CENPFP49454 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PALLD-201ENST00000261509 5809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC107398.3-201ENST00000562284 7000 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CENPFP49454 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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