Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
R4GMQ9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
R4GMQ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
R4GMQ9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
R4GMQ9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
R4GMQ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms