Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms