Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP8A1Q9Y2Q0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms