Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP11BQ9Y2G3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP11BQ9Y2G3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms