Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NUDCQ9Y266 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUDCQ9Y266 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms