Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCAF8Q9UPN6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCAF8Q9UPN6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms