Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FZD1Q9UP38 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FZD1Q9UP38 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms