Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTF2Q9UNY4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTF2Q9UNY4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms