Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNRF3Q9ULT6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNRF3Q9ULT6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms