Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGA1Q9UJY5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms