Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJC5

SH3BGRL2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL2Q9UJC5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SH3BGRL2Q9UJC5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms