Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SCN11AQ9UI33 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCN11AQ9UI33 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms