Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms