Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV8

PEF1, Peflin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEF1Q9UBV8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEF1Q9UBV8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms