Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DKK4Q9UBT3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms