Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC6Q9UBN7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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