Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRBP1Q9P2E9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRBP1Q9P2E9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms