Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALCOCO1Q9P1Z2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALCOCO1Q9P1Z2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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